2016年10月，中央深改组第28次会议研究决定在全国全面推行河长制；11月，中办、国办联合印发了《关于全面推行河长制的意见》。省委省政府高度重视，尤权书记、于伟国省长作出重要指示，要求水利厅结合福建实际，牵头起草《福建省全面推行河长制实施方案》（以下简称“《实施方案》”）。期间，于伟国省长召开专题会议进行研究，提出明确要求；倪岳峰副书记、张志南常务副省长、洪捷序副省长分别审阅了方案并提出意见、帮助协调；黄琪玉副省长5次召集相关部门细化研究，主持方案修改；省直有关部门和部分市县区也积极参与，提出意见建议。
今年2月20日、24日，省政府常务会议、省委常委会议分别对《实施方案》进行了审议。2月27日，《福建省全面推行河长制实施方案》由省委办公厅、省政府办公厅联合印发实施。3月1日起，我省按此方案全面推行河长制。
《实施方案》主要内容为：一个目标、四项原则、四大任务、五级架构、六个机制。
一、一个目标
坚持节水优先、空间均衡、系统治理、两手发力，大胆探索、先行先试，以更高的要求、更严的标准、更实的举措全面推行河长制，先行先试，实现组织体系全覆盖、保护管理全域化、履职尽责全周期，做到有专人负责、有监测设施、有考核办法、有长效机制，进一步构建责任明确、协调有序、监管严格、保护有力的河流保护管理机制，维护河流健康生命，实现河流功能永续利用，为“再上新台阶、建设新福建”提供支撑保障。
二、四项原则
强调全面推行河长制，要坚持生态优先、绿色发展；坚持党政领导、统筹协调；坚持问题导向、属地管理；坚持强化监督、全员参与。
三、四大任务
细化治水要求，提出四大任务，着力解决群众反映强烈、威胁生态安全的突出问题，并明确了阶段性目标。一是加强水资源管理。落实最严格水资源管理制度，实行水资源消耗总量和强度双控行动，严格水功能区管理监督，控制排污总量和污染项目审批。二是加强水污染防治。以工矿企业、城镇生活、畜禽养殖、水产养殖、农业面源、船舶港口等污染防治为重点，改善水生态环境质量。三是加强水环境治理。建立健全水环境风险评估排查、预警预报与响应机制；加强黑臭水体治理、生活污水垃圾处理、饮用水水源保护区内违法建筑和排污口清理。四是加强水生态修复。推进河流生态修复与保护，评估河流健康，落实空间管控，加强城镇平原河网和农村小微河道“毛细血管”治理，加强水土流失治理，推进安全生态水系建设，保护河滩湿地，完善生态保护补偿机制。
四、五级架构
组织机构，从省到村，五级穿透。还设置了河长制办公室，明确了成员单位职责，为加强河流保护管理做好组织保障。
一是省级河长。总河长，由于伟国省长亲自担任；张志南常务副省长、洪捷序副省长、黄琪玉副省长担任副总河长，并兼任干流跨设区市的三条主要河流闽江、九龙江、敖江流域河长。
二是市县乡级河长。以行政区域为单位，市县乡三级分别设立河长，由党委或政府主要领导担任；以河流流域为单位，市县乡分级分段设立河长，由党委或政府相关领导担任。
三是河道专管员。由乡镇根据河道数量、大小和任务轻重等招募并管理河道专管员，负责村居河道的日常巡查与信息反馈、配合相关部门现场执法和涉水纠纷调处、引导公众参与等工作。河道保洁与涉河工程管护等工作可由河道专管员承担，也可通过购买服务等方式由专业队伍承担。河道专管员补助由市县乡三级分担，省级财政适当补贴。
四是河长制办公室。省市县乡四级设置河长制办公室，由水利会同环保部门牵头组建。省级河长制办公室设在水利厅，主任由我兼任，专职副主任由水利厅、环保厅各1位副厅长级干部担任，副主任由省住建厅、农业厅各1位副厅长兼任；成员由省委办、政府办、发改委等14个部门组成。日常事务由水利厅1个专门处室承担。环保厅、住建厅、农业厅各派1名干部挂职副处长；相关部门派出业务骨干到该处室挂职，两年一换。水利厅设立事业性质的河务管理中心。
五、六个机制
建立相互衔接、相互配套的六个机制，共同发挥作用。
一是集中统一的协调机制。要求各级政府比照省里设置河长制办公室，通过集中办公，使协调工作日常化；各成员单位通过联席会议，明确任务，分头行动，做到责任不转移。
二是全域治理的责任机制。强调党政同责、属地管理，部门联动、各负其责；整体思维，系统治理，综合治水，逐年实施，因地制宜，“一河一策”。
三是科学严密的监测机制。在行政区交界面、干支流交界面、功能区交界面和主要入河排污口细化加密监测点，整合共享环保、水利、住建、农业等相关监测数据，问题及时发现，适时通报，科学分析，找准根源。
四是齐抓共管的督导机制。每年编制责任清单、任务清单，定期开展督导检查，重大问题限期整改，验收反馈；建立“智慧河流”平台，推进河务监管网格化；借助第三方监察，加强河流保护管理效果的监督和评价。
五是协同联动的执法机制。既明确涉河涉水重要事件要开展联合执法；又强调相关职能部门按照执法主体不变、执法权能不变、执法体系不变，加强日常监管执法；同时鼓励有条件的地方优化流域行政执法职能配置，开展综合或专项治理。
六是奖惩分明的考评机制。建立年度考评、逐级述职等制度，并将考评结果与生态补偿、以奖代补挂钩，纳入政府绩效考评和领导干部自然资源资产离任审计，发现问题问责追责。
