近年来，禽畜养殖业正逐步向集约化、专业化方向发展，污染总量增加，并呈相对集中趋势，成为较大“污染源”。此外，水产养殖在养殖过程中投放大量的香精饵料、鲜活饵料、肥料和药物，也易造成河道水体污染。许多地方和企业在生产上想得多，在农业废弃物处理上做得少，急需补齐短板。
据了解，现在处理废弃物最简单的办法是“上山下乡”或“退城进郊”。多数企业在退城后形成了在农村散户养殖，加工留在企业的格局。即使采用供种、饲料、防疫、加工“四统一”生产模式，却很难将散养户纳入生产的全程监管，还增加了运输中可能的疫情传播和动物交叉感染等问题。
有关部门应探寻多元农村废弃物处理办法。一是把养殖户集中起来，形成相对集中的养殖区域，并给予一定扶持，较好地解决养殖生产中畜禽粪便污染、动物集中防疫问题，还能提高畜禽产品的质量；二是探索利用固液分离机等进行粪便分离处理，把规模化养殖场每天产生的大量粪便，进一步转化为有机肥和农田灌溉用水，循环利用；三是在农业生产过程中施用绿色有机肥、节水灌溉、精准施药，让农业及养殖剩余物饲料化、肥料化或能源化，实现传统的“资源—产品—废弃物”线性生产方式向“资源—产品—废弃物—再生资源”的循环发展方式转变，节能减排，促进可持续发展。
