我国是世界畜产品生产和消费大国，肉蛋产量连续多年居世界第一位，奶类产量居世界第三位，蛋类人均占有量超过发达国家水平，肉类人均占有量超过世界平均水平，奶类人均占有量达到世界平均水平的1/3。随着中国特色社会主义进入新时代，我国畜产品生产已由数量导向迈入质量导向的新阶段。实现畜牧业高质量发展，必须抓好畜禽遗传资源这个良种的源头，增加“特、精、美”和优质畜产品供给，推进畜牧业供给侧结构性改革。要针对当前地方畜禽遗传资源生存状况日益严峻、开发利用不足、主要畜种种源过多依赖引进品种等突出问题，加快建立健全畜禽遗传资源保护保存、考核评价、监测预警、科技创新和开发利用等五大体系，全面提升我国畜禽遗传资源保护与利用水平。
第一，健全保护保存体系，应保尽保。落实分级保护制度，完善原产地保护和异地保护相结合、活体保种和遗传物质保存互为补充的畜禽遗传资源保护保存体系，提高保护效率。调整优化畜禽遗传资源保护名录，列入名录中的遗传资源都要落实责任，宜建保种场的就建保种场，宜建保护区的就建保护区，宜建基因库的就建基因库。实施个性化保护方案，选派专家开展一对一、点对点的技术指导，确保保护效果。加大生物技术保种力度，对已濒危或有濒危迹象的地方品种，采取抢救性保护，通过制作胚胎、精子等遗传物质尽快保存起来，为开发利用打好基础。
第二，完善考核评价体系，激励推保。制定考核评价制度，奖优罚劣。充分发挥国家畜禽遗传资源委员会专家作用，研究建立保种场、保护区和基因库保种工作评价规范。开展地方畜禽遗传资源保护绩效管理，对各级保种场、保护区和基因库的保种工作、保种效果、管理状况等方面进行综合考核评价，建立保种单位奖励和退出机制，督促强化保种工作措施落地。
第三，加强监测预警体系，动态施保。组织实施畜禽地方品种登记，搭建信息平台，建立健全国家畜禽遗传资源动态监测预警体系，实现对地方畜禽遗传资源的动态保护。监测保种场、保护区和基因库的保护状况，根据畜禽遗传资源濒危状况判定标准，及时有效预警资源濒危风险，提高地方畜禽遗传资源保护的针对性和前瞻性。
第四，强化科技创新体系，科企联保。密切产学研联系，加快科技创新和成果转化，大力开展地方畜禽遗传资源种质特性研究、评估分析与优良基因挖掘。制定完善地方畜禽品种养殖技术规范、品种标准及其产品标准，加快推广，提升市场占有率。创新完善畜禽遗传资源保护理论，深入开展水禽和蜜蜂保种技术研究，加快猪、马等畜种的胚胎、精子、细胞等遗传物质超低温冷冻保存技术研发，解决制约地方畜禽遗传资源保护与利用工作发展的技术瓶颈，不断提升资源保护与利用科技创新水平。
第五，做强开发利用体系，以用促保。以经济效益优良、种质特性优异的地方畜禽品种为核心，以区域特色明显、养殖传统悠久的市县为重点，加快产业化开发，推动传统产业转型升级。以市场需求为导向，以地方品种为主要素材，采用常规育种与分子育种技术，培育一批优质、高产、抗病、节粮型新品种和配套系。加快已育成新品种和配套系的产业化开发，打造知名品牌，增加特色畜产品供给。拓展地方特色畜禽遗传资源的娱乐性、竞技性、药用性等价值，深入挖掘传统文化内涵，发展壮大特色畜禽产业。完善利益分享机制，逐步建立以有效保护促进开发利用，以开发利用成效反哺保护工作的良性循环。
通过着力抓好五大体系建设，确保重要资源不丢失，种质特性不改变，经济性状不降低，力争到2020年，国家和地方保护品种有效保护率分别达到95%和80%，到2025年，国家和地方保护品种有效保护率分别达到98%和85%。创新自主产权品种，培植一批在国内具有较强影响力的育繁推一体化现代畜禽育种企业，力争到2025年，地方畜禽品种产业化开发率达到70%，主要畜种核心种源自给率达到70%，构建起具有中国特色的现代畜禽种业，基本形成资源保护与利用相结合、资源优势和产业优势相融合、畜产品供应大众普惠型和优质特色型各得其美的新格局。
