截至目前，我国涉农资金管理体制机制逐步完善，统筹整合的长效机制初步健全，涉农资金管理体制机制建设取得了阶段性成果。
2018年，财政部与农业农村部、水利部、国家林业和草原局建立涉农资金统筹整合的会商协调机制。财政部出台了《林业改革发展资金预算绩效管理暂行办法》《水利发展资金绩效评价管理办法》《扶贫项目资金绩效管理办法》等一系列绩效管理制度。近期，正在进一步完善涉农资金绩效管理制度，优化绩效评价指标体系。
按照预算管理有关规定，相关涉农资金中每项资金均对应一项管理办法，实现了制度管钱、管人、管事。目前中央财政专项扶贫资金审批权限已经下放到县级，其他相关涉农资金审批权限全部下放到省级。同时，要求省级部门推动下放审批权限，强化基层统筹使用涉农资金的责任。
财政部表示，将加快健全涉农资金统筹整合长效机制。进一步强化“三农”投入保障，提升涉农资金使用效益。深入推进涉农资金实质性整合，督促未出台方案的省份尽快出台实施方案。科学合理划分任务清单，促进提升乡村治理能力和水平。督促指导地方依法依规按程序整合涉农资金，加强涉农资金监管，形成权责明确、有效制衡、齐抓共管的监管格局。
