1、稻飞虱：预计双季晚稻稻飞虱中等发生，发生面积5.85万亩次。主要预测依据：（1）前期迁入量较少：福清市 7月21日至8月15日累计诱虫量龙山点为0头，城头点为0头，新厝点为187头（去年同期分别为0头、426头、157头）。（2）当前田间虫口基数小：8月15日龙山平均百丛110.7头，比2015年同期增加103.9％，比常年同期增加33.4％。8月15日永泰县田间调查，百丛虫量350-1580头，平均965头；与去年同期每百丛310-1080头，平均698头增加38.3%，8月26日连江县调查平均百丛虫量为400头，最高2000头，比去年同期平均百丛虫量为2000头，最高50000头要低得多；福清站调查226头/百丛，最高514头/百丛。（3）秋季气温适宜，是稻飞虱繁殖的良好季节，且8－9月多吹东北风，有利于稻飞虱的回迁与繁殖，且历年晚季北方回迁虫源以褐飞虱为主，因此要警惕晚稻后期褐飞虱在局部地方偏重发生。预计9月下旬双季晚稻破口抽穗期田间褐飞虱虫口密度将迅速增加。随着中稻的成熟，稻飞虱将不断由中稻田转移至双晚稻田为害。
2、稻纵卷叶螟：预计双季晚稻稻纵卷叶螟将中等发生，发生面积4.95万亩次。主要预测依据：第五（4）代稻纵卷叶螟轻发生，发生比去年同期重。福清站调查7月底至8月5日稻纵卷叶螟大量迁入。8月5日龙山晚稻田平均卷叶率0.83%,平均百丛幼虫量4.8头；8月15日龙山晚稻田平均卷叶率2.18%，平均百丛幼虫量28.8头，分别比2015年同期增加20.8倍和17倍。常年8月下旬至9月中旬外地虫源多次迁入，迁入峰期长，田间稻纵卷叶螟峰次多，预计第六（5）代中等发生，第七代偏轻发生。
3、螟虫：预计螟虫中等发生。其中三化螟为轻发生，预计发生面积0.43万亩次；二化螟中等发生，预计发生面积5.9万亩次。据福清调查：（1）三代灯下二化蛾量偏少：至8月15日，龙山点共诱二化螟蛾245头, 比2015年同代同期216头增加13.4%，比2014年同代同期374头减少34.5%。三代灯下三化蛾量较少。（2））当前田间螟害率和幼虫量均较低：8月15日龙山晚稻枯鞘率平均0.75％，二化螟平均亩幼虫量256头（2015年同期分别为2.05％和320头；2014年同期分别为0.56％和384头）。
4、稻瘟病：双季晚稻叶瘟、穗瘟轻发生，预计发生面积为0.13万亩。主要原因:一是当前全市未发生双季晚稻叶瘟；二是当前大部分水稻品种抗病性不高，一旦条件适宜极易发病；三是气候条件对稻瘟病的发生发展十分有利。当前气候为时晴时雨，田间湿度大，有利叶瘟的发生发展。如果双季晚稻破口抽穗期遇秋雨及秋寒天气，局部老病区感病品种将偏重发生的可能。
5、稻纹枯病：为常发性病害，预计中等发生，发生面积6.7万亩。据8月24日统计纹枯病已发生0.05万亩，比去年同期0.8万亩少得多。近期多台风雨气候，适温高湿，随着双季晚稻的封行，有利稻纹枯病发生蔓延。并且品种抗病能力差、化肥施用量大、抗病能力弱、防治不够重视。
6、细菌性条斑病：预计细条病中等发生，发生面积0.76万亩。由于受台风影响，目前晚稻以发生0.002万亩。
此外，其它病虫如稻蝗、稻叶蝉、白叶枯病、南方水稻黑条矮缩病、病毒病等轻发生。
